Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip6Q9Z1Y4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip6Q9Z1Y4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms