Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms