Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nme3Q9WV85 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms