Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psma1Q9R1P4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms