Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AmfrQ9R049 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms