Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rnf4Q9QZS2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rnf4Q9QZS2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rnf4Q9QZS2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rnf4Q9QZS2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rnf4Q9QZS2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rnf4Q9QZS2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rnf4Q9QZS2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rnf4Q9QZS2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rnf4Q9QZS2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rnf4Q9QZS2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Rnf4Q9QZS2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf4Q9QZS2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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