Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms