Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
VapbQ9QY76 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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