Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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