Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Dkk3Q9QUN9 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Dkk3Q9QUN9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Dkk3Q9QUN9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Dkk3Q9QUN9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Dkk3Q9QUN9 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Dkk3Q9QUN9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Dkk3Q9QUN9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms