Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gde1Q9JL56 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms