Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms