Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hipk3Q9ERH7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms