Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Tfcp2Q9ERA0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tfcp2Q9ERA0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms