Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clstn2Q9ER65 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms