Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH4

Taf8, Transcription initiation factor TFIID subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf8Q9EQH4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Taf8Q9EQH4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms