Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csnk1dQ9DC28 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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