Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Alkbh4Q9D8F1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Alkbh4Q9D8F1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms