Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slx4ipQ9D7Y9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slx4ipQ9D7Y9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms