Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tube1Q9D6T1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tube1Q9D6T1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tube1Q9D6T1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tube1Q9D6T1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tube1Q9D6T1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tube1Q9D6T1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tube1Q9D6T1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tube1Q9D6T1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tube1Q9D6T1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tube1Q9D6T1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tube1Q9D6T1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tube1Q9D6T1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tube1Q9D6T1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tube1Q9D6T1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tube1Q9D6T1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tube1Q9D6T1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tube1Q9D6T1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tube1Q9D6T1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tube1Q9D6T1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tube1Q9D6T1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tube1Q9D6T1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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