Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc7Q9D541 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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