Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zc2hc1bQ9D534 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms