Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm3404Q9D506 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm3404Q9D506 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm3404Q9D506 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm3404Q9D506 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm3404Q9D506 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm3404Q9D506 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm3404Q9D506 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm3404Q9D506 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm3404Q9D506 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm3404Q9D506 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm3404Q9D506 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm3404Q9D506 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm3404Q9D506 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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