Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Syce1Q9D495 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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