Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rsph14Q9D3W1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rsph14Q9D3W1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rsph14Q9D3W1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rsph14Q9D3W1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rsph14Q9D3W1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rsph14Q9D3W1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rsph14Q9D3W1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rsph14Q9D3W1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rsph14Q9D3W1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rsph14Q9D3W1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rsph14Q9D3W1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rsph14Q9D3W1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rsph14Q9D3W1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rsph14Q9D3W1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rsph14Q9D3W1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rsph14Q9D3W1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rsph14Q9D3W1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms