Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx29Q9D3S3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms