Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lamp5Q9D387 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms