Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms