Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Zbed3Q9D0L1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Zbed3Q9D0L1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Zbed3Q9D0L1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Zbed3Q9D0L1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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