Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Mms19Q9D071 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Mms19Q9D071 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Mms19Q9D071 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mms19Q9D071 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mms19Q9D071 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mms19Q9D071 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mms19Q9D071 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mms19Q9D071 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mms19Q9D071 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Mms19Q9D071 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Mms19Q9D071 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Mms19Q9D071 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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