Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Shmt2Q9CZN7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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