Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Gins3Q9CY94 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Gins3Q9CY94 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gins3Q9CY94 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms