Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpl11Q9CXW4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl11Q9CXW4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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