Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Sgo1Q9CXH7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Sgo1Q9CXH7 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Sgo1Q9CXH7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Sgo1Q9CXH7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Sgo1Q9CXH7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Sgo1Q9CXH7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Sgo1Q9CXH7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Sgo1Q9CXH7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Sgo1Q9CXH7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Sgo1Q9CXH7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sgo1Q9CXH7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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