Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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