Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rpusd4Q9CWX4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpusd4Q9CWX4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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