Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NubplQ9CWD8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NubplQ9CWD8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms