Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dis3Q9CSH3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms