Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Smim8Q9CQQ0 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms