Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccer1Q9CQL2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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