Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nudt21Q9CQF3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nudt21Q9CQF3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms