Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atp6v0e1Q9CQD8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atp6v0e1Q9CQD8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms