Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
1700029P11RikQ9CQ68 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms