Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
4921530L21RikQ9CQ47 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4921530L21RikQ9CQ47 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms