Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Smim3Q99PE5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Smim3Q99PE5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms