Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Mrpl43Q99N89 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms