Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Hdac9Q99N13 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Hdac9Q99N13 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Hdac9Q99N13 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Hdac9Q99N13 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Hdac9Q99N13 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Hdac9Q99N13 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Hdac9Q99N13 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Hdac9Q99N13 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Hdac9Q99N13 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Hdac9Q99N13 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac9Q99N13 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hdac9Q99N13 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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