Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ms4a4dQ99N05 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ms4a4dQ99N05 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms