Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SrrtQ99MR6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SrrtQ99MR6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms