Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp1b4Q99ME6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms